“营改增”对物流企业冲击最大。为了合理避税，不少交通运输企业或许将转变经营方向，由运输业务转向仓储、货代等贸易方向，促使产业升级。按照规定，自身有运输业务的物流企业，按交通运输业适用11%的税率。自身没有运输业务的物流公司，包括仓储、货代等，按物流辅助业适用6%的税率。 

　　从目前外省市试点情况看，由于交通运输行业税负增加较大，与为企业减负的税收改革初衷背道而驰，各地普遍设立了“营业税改增值税改革试点财政扶持资金”，对试点企业根据税制改革前后比较，实际税负确实有所增加的，可以向财税部门申请专项资金扶持，增加部分以退税形式返还企业。 

　　有专业人士认为，税收政策的变化，将促使企业自身调整，在新税改的推动下，一些大型企业内部的物流公司为了合理避税，将加速独立出来，壮大第三方方物流力量，令物流业分工更加合理。